Projekty Instytut Misesa poza wydawaniem książek zajmuje się organizacją szeregu projektów mających na celu kształcenie „kompetentnych rzeczników przekazujących zrozumiałą wiedzę ekonomiczną oraz rzetelnie krytykującym idee, które czerpią swą siłę z błędnej wiedzy o stosunkach społeczno-gospodarczych” Do projektów tych należą: Szkoły Ekonomiczne (dawniej: Zimowe Szkoły Ekonomiczne, Letnie Seminarium Ekonomiczne, Letnie Seminarium Austriackie), Zjazdy Austriackie, sieć Klubów Austriackiej Szkoły Ekonomii, Lekcje Ekonomii dla Młodzieży (wspólnie ze Stowarzyszeniem KoLiber), Seminaria zaawansowane, Konkursy na esej publicystyczny i naukowy, Program tutoringowy.
Ponadto Instytut prowadzi projekt „Dziedzictwo”, w ramach którego promuje dokonania często zapomnianych polskich ekonomistów.
W latach 2008–2009 ekonomiści Instytutu prowadzili Kryzys BlogaBlog., na którym śledzili kryzys finansowy. Pod koniec 2011 roku blog został reaktywowany, tym razem koncentrując się na problemach strefy eurohttp://mises.pl/blog/2011/12/18/kryzys-blog-instytutu-misesa-powraca/ Instytut Misesa „Kryzys Blog Instytutu Misesa powraca”..