Młodzi Wojownicy wraz ze swoimi rozmawiającymi Bakuganami muszą sprostać wielu przeciwnościom, by na koniec dotrzeć do Nagi, pokonać go i uratować zarówno Świat Ludzi jak i Vestroię przed absolutną zagładą.
Vestroia i Geneza Bakuganów Miliony lat temu od bezkształtnej istoty znanej jako „Code Eve”. Za jej sprawą powstały 2 pierwsze rasy Bakuganów zamieszkałych w Vestroii - Dragonoid oraz Dharaknoid. Owa istota uznała, że nie mogą one istnieć obok siebie, więc pewnego razu dochodzi do katastrofy, w którym rdzeń tegoż świata zostaje podzielony, a sama planeta rozpada się na sześć domen w wyniku czego tysiące Bakuganów w tym Dharaknoid (ucieleśnienie chaosu) zostają wysłane na planetę Gundalia w innym wymiarze, Dragonoid (ucieleśnienie porządku) pozostał w Vestroii dzięki czemu te dwie przeciwstawne siły mogły pozostać odseparowane. Jednak sam Code Eve aby utrzymać równowagę, oraz nie dopuścić do ich ponownego spotkania trafia na Neathię - sąsiednią planetę Gundalii.