1 kwietnia 1943 roku awansował na komandora podporucznika (niem. Korvettenkapitän). W styczniu 1944 roku został dowódcą 22. Flotylli Okrętów Podwodnych, flotylli szkoleniowej dla nowych dowódców okrętów podwodnych. W lipcu 1944 roku został komendantem I Wydziału Akademii Marynarki Wojennej we Flensburgu-Mürwik, a we wrześniu 1944 roku mianowano go komendantem tej uczelni. 1 sierpnia 1944 roku awansował na komandora porucznika (niem. Fregattenkapitän), a 1 września 1944 roku na komandora (niem. Kapitän zur See). Krótko po zakończeniu wojny, w nocy 13/14 maja 1945 roku, Wolfgang Lüth natknął się na niemieckiego wartownika przed swoją akademią morską. Ponieważ Lüth nie mógł się wylegitymować i zapomniał hasła, wartownik oddał strzał ostrzegawczy, nieszczęśliwie trafiając Lütha w głowę. Lüth zginął na miejscu. thumb|Grób Wolfganga Lütha na cmentarzu Adelby (Friedhof Adelby) w Flensburgu Odznaczenia Był wielokrotnie odznaczany: Brązowy Krzyż Hiszpanii Odznaka pamiątkowa dla załogi Nagroda imienia Clausewitza Odznaka dla Załóg Łodzi Podwodnych złota z Diamentami Krzyż Żelazny II i I klasy Krzyż Rycerski Krzyża Żelaznego z Liśćmi Dębu, Mieczami i Brylantami Krzyż Rycerski (24 października 1940) 142. Liście Dębu (13 listopada 1942) 29.