Transport kolejowy w Gdańsku – system transportu kolejowego na terenie miasta Gdańsk.
Sieć linii kolejowych w mieście obsługuje ruch pociągów o zasięgu regionalnym, krajowym i międzynarodowym. W granicach miasta przebiegają m.in. linie kolejowe 9, 201, 202, 250 w tym międzynarodowe E 65, C-E 65.
Pierwszą linią kolejową w mieście był jednotorowy odcinek Tczew – Gdańsk, uruchomiony w 1852 r. stanowiący fragment Pruskiej Kolei Wschodniej (niem. Preußische Ostbahn) z Berlina przez Kostrzyn – Krzyż – Piłę – Bydgoszcz – Tczew do Gdańska i Królewca. W październiku 1857 Gdańsk uzyskał połączenie z Malborkiem. W 1870 oddano do użytku linię Słupsk – Gdańsk wybudowaną przez Berlińsko-Szczecińskie Towarzystwo Kolejowe (Berlin-Stettiner Eisenbahn Gesellschaft). Do końca II wojny światowej funkcjonowała zbudowana w 1914 linia kolejowa Gdańsk Wrzeszcz – Stara Piła – Kartuzy, odbudowana w latach 2022–2023 jako bajpas kartuski.
Kolejowym ciągiem transportowym przechodzącym przez miasto jest również magistrala węglowa łącząca Górny Śląsk i Zagłębie Dąbrowskie z portem w Gdyni. Ciąg ten przechodzi przez Osowę (obecnie dzielnica miasta).