1 października 2008 roku uroczyście zainaugurowano studia na kierunku lekarskim.
1 maja 2009 roku doszło do przejęcia 103 Szpitala Wojskowego w Olsztynie przez Uczelnię jako Szpital uniwersytecki z Przychodnią SP ZoZ UWM, który w czerwcu 2009 roku został otwarty przez ówczesną Minister Zdrowia – Ewę Kopacz.
1 października 2010 roku rozpoczęto studia anglojęzyczne na kierunku lekarskim.
Uniwersytet Warmińsko-Mazurski dokonał dużego wysiłku organizacyjnego, a także poniósł duże koszty własne na adaptację obiektów dla nowo tworzonych katedr i zakładów. Przygotowano liczne projekty pozyskujące środki z funduszy Unii Europejskiej w ramach różnych źródeł finansowania.
28 lutego 2011 r. Centralna Komisja do spraw Tytułów i Stopni Naukowych przyznała Wydziałowi Nauk Medycznych Uniwersytetu Warmińsko-Mazurskiego uprawnienia do nadawania stopnia naukowego doktora nauk medycznych, a w 2016 przyznano uprawnienia do nadawania stopnia doktora habilitowanego w dziedzinie nauk medycznychMedycyna na UWM z przepustką do elity polskiej nauki.. 1 lipca 2012 szpital został przemianowany na Uniwersytecki Szpital Kliniczny.