thumb|480px|Pettersen podczas treningu przed Women’s British Open 2009W czerwcu Pettersen zachorowała na – jak się wtedy wydawało – grypę, w wyniku czego m.in. wycofała się w trakcie z LPGA Championship oraz nie wzięła udziału w Wegmans LPGA. Późniejsze badania wykluczyły jednak grypę nie wskazując równocześnie prawdziwej przyczyny jej problemów ze zdrowiem. Mimo to Pettersen startowała w kolejnych turniejach, w tym w ostatnim wielkoszlemowym turnieju sezonu Women’s British Open, w którym nie przeszła cuta – poprzednio zdarzyło się to jej w Women’s U.S. Open w 2007 roku.
Pod koniec sierpnia 2009 Pettersen po raz piąty wystąpiła w drużynie Europy podczas rozgrywek Solheim Cup. Rozegrała w nim maksymalną liczbę pięciu meczów, ale zdobyła tylko jeden punkt wygrywając w parze z Anną Nordqvist.
Słaby występ w Women’s British Open i Solheim Cup nie był jednak zwiastunem spadku formy. W pierwszym turnieju po Solheim Cup – Safeway Classic – Pettersen zajęła drugie miejsce. Norweżka prowadzenie w tym turnieju zdobyła dopiero podczas ostatniej rundy. Kilka błędów popełnionych na ostatnich dołkach spowodowało jednak, że straciła je i o zwycięstwie musiała zadecydować dogrywka, którą przegrała.