Autolustracja Po publikacjach prasowych w 2008 roku dotyczących domniemanej współpracy ze Służbą Bezpieczeństwa PRL prof. Kordan złożył do Sądu Okręgowego w Olsztynie wniosek o autolustrację. Według Oddziału Instytutu Pamięci Narodowej w Białymstoku Władysław Kordan miał być tajnym współpracownikiem SB o pseudonimie „Paweł” w latach 1980-1986. Działający w pierwszej instancji Sąd Okręgowy w Olsztynie wydał orzeczenie 30 grudnia 2011 roku, w którym uznał, że profesor złożył niezgodne z prawdą oświadczenie lustracyjne. Od tego wyroku Władysław Kordan odwołał się do Sądu Apelacyjnego w Białymstoku, który w kwietniu 2012 roku uchylił wyrok i skierował sprawę do ponownego rozpatrzenia. Po ponownym rozpatrzeniu sprawy przez Sąd Okręgowy w Olsztynie, 29 listopada 2013 roku profesor został uniewinniony. Decyzję sądu zaskarżył prokurator IPN w Białymstoku. Sąd Apelacyjny ponownie nakazał rozpatrzenie sprawy. Na kolejnym posiedzeniu Sądu Okręgowego w Olsztynie profesor Kordan wycofał wniosek o autolustrację, a Sąd przychylił się do tego wniosku. Prokurator IPN złożył zażalenie w sprawie tego postanowienia. W dniu 5 grudnia 2014 roku Sąd Apelacyjny w Białymstoku prawomocnie postanowił utrzymać w mocy decyzję Sądu Okręgowego w Olsztynie i umorzył postępowanie lustracyjne wobec prof.