Po 1933 roku nie stracił pracy mimo żydowskiego pochodzenia; wcześniej przeszedł na chrześcijaństwo. W 1936 roku wyemigrował do Stanów Zjednoczonych i osiadł w Nowym Jorku. W opuszczeniu Niemiec i emigracji pomógł Kallmannowi przewodniczący Niemieckiego Ośrodka Badań Psychiatrycznych w Monachium i lider ruchu eugenicznego, Ernst Rüdin.
W 1948 roku Kallmann był współzałożycielem American Society of Human Genetics i czasopisma „American Journal of Human Genetics”.
Kallmann prowadził pionierskie badania nad dziedzicznymi uwarunkowaniami chorób psychicznych. W 1944 roku razem z Schönfeldem i Barrerą opisał zespół znany dziś jako zespół KallmannaF. J. Kallmann, W. A. Schönfeld, S. E Barrera: The genetic aspects of primary eunuchoidism. American Journal of Mental Deficiency 1943-1944, 48: 203-236..
Wybrane prace The genetics of schizophrenia; a study of heredity and reproduction of the families of 1,087 schizophrenics. New York: JJ Augustin, 1938. 291 ss. Kallmann FJ, Reisner FJ. Twin studies on the significance of genetic factors in tuberculosis. The American Review of Tuberculosis 47, s. 549 (1943) The genetic aspects of primary eunocchoidism (1944) The genetic theory of schizophrenia.