W dniu 25 marca 2012 roku erygowano przy bazylice Nowomiejską Kapitułę Kolegiacką – tym samym kościół otrzymał godność kolegiaty.
Ważniejsze wyposażenie tryptyk późnogotycki 1 połowa XVI wieku ołtarz główny wykonany około 1630 nagrobek gotycki Kunona von Liebensteina (zmarłego 1391) renesansowy nagrobek Mikołaja Działyńskiego (zmarłego 1604), wojewody chełmińskiego. Wielką rzadkością jest chorągiew żałobna Pawła Jana Działyńskiego (zmarłego 1643), wojewody chełmińskiego, ślad po rozpowszechnionym ongiś obyczaju staropolskim (20 lat była w renowacji, obecnie można ją oglądać w Muzeum im. Działyńskich w Nowym Mieście Lubawskim).
Sanktuarium Matki Bożej Łąkowskiej W wyniku spalenia kościoła klasztornego w Łąkach Bratiańskich w 1882 r. do kościoła parafialnego w Nowym Mieście została sprowadzona łaskami słynąca figura Matki Boskiej z Dzieciątkiem. Figura Matki Boskiej Łąkowskiej została ukoronowana koronami papieskimi 4 czerwca 1752 za pontyfikatu Benedykta XIV. Koronacji dokonali biskupi Wojciech Stanisław Leski i Fabian Franciszek Pląskowski. Bazylika to również afiliowane w 2004 r. do Papieskiej Bazyliki Matki Bożej Większej w Rzymie sanktuarium Matki Bożej Łąkowskiej.
Organy Organy zostały wybudowane przez Bruna Goebela w 1908 roku jako opus 256.