Johann Heinrich Ludwig Flögel (ur. 10 czerwca 1834 w Glückstadt, zm. 25 stycznia 1918 w Ahrensburgu) – niemiecki prawnik i przyrodnik amator (Privatgelehrter). Pracował w Bad Bramstedt jako notariusz.
W 1889 roku w wieku 55 lat przeszedł na wcześniejszą emeryturę, zamieszkał w Ahrensburgu i zajął się działalnością naukową. W uznaniu jego prac otrzymał w 1875 roku honorowy doktorat Uniwersytetu w Kilonii. W 1885 roku został honorowym członkiem (Fellow) londyńskiego Royal Microscopical Society.
Flögel zajmował się m.in. neuroanatomią owadów. Autor pierwszych znanych zdjęć płatków śniegu (1879).
Wybrane prace Die Diatomaceen in den Grundproben der Expedition zur Untersuchung der Ostsee. Kiel 1873. (mit Steintafeln) Ueber die Höhe des Nordlichts und dessen Lage im Raum. Kiel 1873. Ueber die Lippen einiger Oxyurisarten, Zeitschrift für wissenschaftliche Zoologie B. 19, H. 2, S. 234 ff. Untersuchungen über die Structur der Zellwand in der Gattung Pleurosigma, M. Schultzens Archiv für mikroskopische Anatomie, Jahrg. 1870, B. 6, S. 472 ff. (mit Tafeln) Ueber die quergestreiften Muskeln der Milben, M. Schultzens Archiv für mikroskopische Anatomie, Jahrg. 1872, B. 8, S. 69 ff. Über den feineren Bau des Arthropodengehirns. Tageblatt der Versammlung Deutscher Naturforscher und Ärzte 49, 115–120.