Był to pierwszy od 20 lat udział jachtu płynącego pod polską banderą w regatach OSTAR.

W 2001 roku wzięła udział na 60-stopowym jachcie „Alphagraphics” z załogą wyłącznie kobiecą w regatach EDS Atlantic Challenge na trasie Saint-Malo – Hamburg – Portsmouth – Baltimore – Boston – Saint-Malo. W tym samym 2001 r. startowała w regatach Transat Jacques Vabre, z Hawru do Brazylii, na jachcie „Olympic Challenger”.

Od grudnia 2002 do stycznia 2003 jachtem Zjawa IV trzykrotnie okrążyła przylądek Horn i dotarła do archipelagu Szetlandy Południowe na Antarktydzie.

Od października 2006 do lutego 2007 w dwuosobowych, kobiecych regatach, rozgrywanych pomiędzy dwoma identycznymi 28-stopowym jachtami typu Mantra 28 przepłynęła (z Darwin w Australii przez Ocean Indyjski do Kapsztadu-RPA i dalej przez Atlantyk do Salvador de Bahia w Brazylii). thumb|left|Trasa rejsu Joanny Pajkowskiej 2008/2009 W okresie od 24 czerwca 2008 do 8 stycznia 2009 kpt. Joanna Pajkowska odbyła samotny rejs dookoła świata. Żeglowała na jachcie „Mantra Asia” (typu Mantra 28) o długości 8,5 m, szerokości 2,7 m i zanurzeniu 1,65 m.