został profesorem Moskiewskiego Instytutu Sowieckiego Handlu Spółdzielczego. Przewodniczył też sekcji planowania w Leningradzkim Naukowym Instytucie Spółdzielczym. W 1940 r. objął funkcję dziekana wydziału finansowego Leningradzkiego Instytutu Finansowo-Ekonomicznego z tytułem doktora nauk ekonomicznych, zaś w 1941 r. – zastępcy ds. naukowych dyrektora Instytutu. Przez cały sowiecki okres kariery naukowej napisał ponad 60 prac z dziedziny ekonomii, które były bardzo cenione w środowisku sowieckich ekonomistów. Wiosną 1942 r. Iwan A. Koszkin ewakuował się wraz z pozostałym personelem Leningradzkiego Instytutu Finansowo-Ekonomicznego do miasta Jessentuki na północnym Kaukazie, gdzie objął funkcję pełniącego obowiązki dyrektora Instytutu.
Po zajęciu miasta przez wojska niemieckie w sierpniu 1942 r., podjął kolaborację z okupantami. Jego córka wyszła za mąż za niemieckiego oficera. W grudniu tego roku wyjechał z miasta wraz z wycofującymi się Niemcami i przyjechał do Berlina, gdzie pracował w fabryce. Jednocześnie przystąpił do Rosyjskiego Ruchu Wyzwoleńczego gen. Andrieja A. Własowa. Pod koniec 1944 r. wszedł w skład Komitetu Wyzwolenia Narodów Rosji (KONR). Na pocz. 1945 r. wyjechał do zachodnich Niemczech zajętych przez wojska amerykańskie.