Pieczęć z tym herbem znajduje się w archiwum gdańskim przy dokumencie z 1384 roku i w archiwum wrocławskim przy dokumencie z 1428 roku.
Po sprzedaży miasta w 1472 roku książętom saskim w herbie Żagania orła zastąpiono czarnym lwem margrabiów miśnieńskich. Taki wzór obowiązywał do 1602 roku, kiedy to 13 marca cesarz, król Czech Rudolf II Habsburg nadał w Pradze w specjalnym przywileju nowy herb miasta: w tarczy czwórdzielnej w krzyż, pierwsze i czwarte pole barwy czarnej, na każdym stojące, złote lwy w koronach zwrócone ku sobie, drugie i trzecie pole barwy czerwonej, na każdym budynek bramy miejskiej w kolorze białym z dwiema blankowanymi basztami po bokach, z otwartą bramą i podniesioną kratą, pod nią duża, czarna litera "S" oznaczająca wówczas nazwę miasta (łac. Saganum, niem. Sagan). Powyżej tarczy herbowej hełm z koroną, przyozdobiony z prawej strony czarno-żółtymi labrami i biało-czerwonymi z lewej. Powyżej hełmu dwa rozpostarte orle skrzydła. Herb ten obowiązywał do 1968 roku. Oryginał jego nadania z 1602 roku przechowywany jest w zbiorach Wojewódzkiego Archiwum Państwowego w Zielonej Górze.
Od 1945 roku, władze miejskie używały na równi z cesarskim znakiem, herbu wzorowanego na pieczęciach z 1384 i 1428 roku.