W maju 1946 przeszła do pracy w Kuratorium Okręgu Szkolnego Warszawskiego. Jako wizytatorka w Referacie Bibliotek nadzorowała pracę bibliotek powszechnych i szkolnych Warszawy i ówczesnego województwa warszawskiego. Ogłosiła w tym okresie artykuł Bibliotekarstwo powszechne w Okręgu Szkolnym Warszawskim („Bibliotekarz”, 1946 nr 11/12). W marcu 1948, w związku z przeprowadzką do Puław, zatrudniła się w bibliotece tamtejszego Państwowego Instytutu Naukowego Gospodarstwa Wiejskiego pod kierownictwem Zygmunta Nowakowskiego. Od stycznia 1951 była zastępcą kierownika biblioteki tego instytutu, noszącego już wówczas nazwę Centralnego Instytutu Rolniczego. W listopadzie 1955 biblioteka stała się filią nowo utworzonej Centralnej Biblioteki Rolniczej. W połowie 1956, dzięki kwalifikacjom i doświadczeniu zawodowemu (także dzięki dobrej znajomości łaciny, niemieckiego i rosyjskiego), Wanda Sampolska uzyskała za rekomendacją resortu rolnictwa nominację na kustosza, mimo niespełnienia wymogów formalnych.