W czasie II wojny światowej na cmentarzu pochowane zostały ofiary obozu Szmalcówka. Po zakończeniu konfliktu przeniesiono na niego część szczątków Żydów zamordowanych w regionie toruńskim oraz żołnierzy i jeńców radzieckich. W maju 1997 roku na cmentarz przeniesione zostały pozostałości pomnika wdzięczności Armii Czerwonej, położonego pierwotnie w centrum Torunia.
Obiekty architektoniczne na terenie cmentarza Na terenie cmentarza znajduje się kostnica, która została wzniesiona w XIX wieku.
Pochowani Większość pochowanych stanowią ofiary II wojny światowej. Rada Ochrony Pamięci Walk i Męczeństwa sprawuje opiekę nad dziewięcioma mogiła i pomnikami, stanowiącymi miejsce pamięci narodowej. W skład mogił wchodzą: mogiła 711 zamordowanych Polaków; mogiła 91 Polaków zamordowanych w latach 1939–1945 w Szmalcówce; mogiła z pomnikiem, mieszcząca się w miejscu złożenia prochów ofiar zbrodni w Barbarce; mogiła 140 Polaków, którzy zmarli podczas powrotu z obozów koncentracyjnych; mogiła z pomnikiem 334 zamordowanych dzieci polskich; mogiła zbiorowa dzieci polskich zmarłych latach 1940–1943 w Szmalcówce; mogiła pomordowanych Żydówek z Chorabia; mogiła 541 żołnierzy Armii Czerwonej poległych w 1945 roku; pomnik Sybiraków W hołdzie pomordowanym i zmarłym na nieludzkiej ziemi w latach 1940-1956.