dyniowatych, zgnilizna twardzikowa, zgorzel siewek.
Systematyka i zmienność Ogórek siewny jest jednym z 30 gatunków wyróżnionych w obrębie rodzaju ogórek (Cucumis), podzielonych na dwie grupy ze względu na liczbę chromosomówJeffrey C., 1980. A review of Cucurbitaceae, Bot. J. Linnol. Soc., 81:233-247.. Dziko występującą odmianą ogórka siewnego jest Cucumis sativus var. HardwickiiPerl – Treves R., Galum E., 1985. The Cucumis plastome: physical map, intergenetic variation and phylogenetic relationships, Theor. Appl. Genet., 71:417-429..
Wyróżnia się 12 odmian botanicznych ogórka siewnego: Cucumis sativus var. anatolicus Cucumis sativus var. ciliciosus Cucumis sativus var. europaeus Cucumis sativus var. falcatus Cucumis sativus var. indo-europaeus Cucumis sativus var. irano-turanieus Cucumis sativus var. izmir Cucumis sativus var. sikkimensis Cucumis sativus var. squamosus Cucumis sativus var. testudaceus Cucumis sativus var. tuberculatus Cucumis sativus var. vulgarus
Analiza izoenzymatyczna podanych odmian botanicznych wykazała, że