W dniu 20 stycznia 2001 roku poślubił Jennie Garth, znaną jako Kelly Taylor z opery mydlanej dla młodzieży Beverly Hills, 90210, którą poznał na planie telewizyjnego dramatu ABC Przerwany romans (An Unfinished Affair, 1996). Mają trzy córki: Luca Bella (ur. 22 czerwca 1997), Lolę Ray (ur. 6 grudnia 2002) i Fionę Eve (ur. 30 września 2006). Rozwiedli się w czerwcu 2013. 1 stycznia 2020 Facinelli zaręczył się z Lily Anne Harrison, którą poznał w aplikacji randkowej Raya. Para ma jedno dziecko. Kolarka Letizia Paternoster jest jego siostrzenicą.
Filmografia Filmy 1995: Angela jako Lucyfer 1996: Wtajemniczenie (Foxfire) jako Ethan 1997: Dotknij mnie (Touch Me) jako Bail 1998: Szalona impreza (Can't Hardly Wait) jako Mike Dexter 1998: Mówię Ci (Telling You) jako Phil Fazzulo 1998: Dancer, Texas Pop.