Nilmar zerwał współpracę z klubem Santos, po wystąpieniu w zaledwie dwóch meczach.
Kariera reprezentacyjna W reprezentacji Brazylii Nilmar zadebiutował 13 lipca 2003 roku w przegranym 1:0 pojedynku z Meksykiem w ramach turnieju Gold Cup. Pierwszą bramką dla drużyny narodowej strzelił natomiast 18 sierpnia 2004 roku zespołowi Haiti. Po raz pierwszy do reprezentacji swojego kraju Nilmar został powołany przez Dungę jako zastępca dla kontuzjowanego Rafaela Sóbisa na mecze eliminacyjne do mistrzostw świata. 9 września 2009 roku strzelił hat-tricka w wygranym spotkaniu z reprezentacją Chile (4:2).
Depresja 16 września 2017 roku zawieszono jego kontrakt z Santosem w celu leczenia depresji. Lekarze uznali, że ponad roczna przerwa w uprawianiu piłki nożnej na Bliskim Wschodzie mogła przyczynić się do wystąpienia objawów, ponieważ jedną z przyczyn depresji jest niedobór serotoniny, noradrenaliny i dopaminy – substancji wytwarzanych przez organizm podczas uprawiania piłki nożnej. Santos potwierdził jego zawieszenie do czasu powrotu do zdrowia.