Lista prefektów Kongregacji W ciągu pierwszego stulecia działalności prefektem tej Kongregacji był prawie zawsze jej kardynał dziekan, tj. najwyższy rangą kardynał będący jej członkiem, a w przypadku jego absencji, jego obowiązki przejmował automatycznie kardynał najwyższy rangą spośród obecnych, chyba że papież wyraźnie wyznaczył na prefekta kogoś innegoWeber, s. 198-199, 241; por. Moroni, vol. XVI, s. 138.. Dopiero w 1675 ówczesny papież Klemens X zadecydował, że objęcie funkcji prefekta nie następuje automatycznie, lecz konieczna jest formalna nominacja ze strony papieża. Jednakże aż do pierwszej połowy XVIII wieku nominacje te otrzymywali najczęściej dziekani lub wicedziekani Kongregacji.
Alfonso Gesualdo (1588–1603) Tolomeo Gallio (1603–1607) Domenico Pinelli (1607–1611) François de Joyeuse (1611–1615) Antonio Maria Galli (1615–1620) Francesco Maria Bourbon del Monte (1620–1626) Giovanni Battista Deti (1626–1630) Carlo Emmanuele Pio (1630–1641) Pier Paolo Crescenzi (1641–1645) Luigi Capponi (1645–1652) Federico Cornaro (1652–1653) Carlo de’ Medici (1653–1655)cf. Weber, s. 275, 295. Giulio Cesare Sacchetti (1655–1663) Marzio Ginetti (1663–1671)Weber, s.