Protestantyzm w Salwadorze zyskuje coraz więcej zwolenników. Choć katolicyzm jest w tym kraju nadal religią dominującą, obserwuje się obecnie gwałtowny rozwój wyznań protestanckich. W 2008 r. według Międzynarodowego Raportu Wolności Religijnej protestanci stanowili 27,6% społeczeństwa SalwadoruMiędzynarodowy Raport Wolności Religijnej z 2008 r.. Według Pew Research Center w 2010 roku w Salwadorze było ponad 2,2 miliona protestantów i stanowili 35,7% populacji. Pierwsi misjonarze protestanccy, wysłani przez Centralną Misję Amerykańską, przybyli do Salwadoru w latach 90. XIX wieku. Dzisiaj, bezpośrednio pod misję podlega 150 zborów z 13 tysiącami wyznawców.

Do najlepiej rozwijających się wyznań protestanckich w kraju należą zielonoświątkowcy (Zbory Boże). Dobry wskaźnik rozwoju odnotowują także metodyści, prezbiterianie i adwentyści dnia siódmego. Według Operation World największe nurty stanowią: ruch zielonoświątkowy (23,5%), baptyzm (ok. 4%) i adwentyzm (2,8%).

Misjonarze Kościoła Adwentystów Dnia Siódmego dotarli do tego kraju w 1915 r. Obecnie w Salwadorze żyje 188 tysięcy adwentystów.