Puchar Świata w lotach narciarskich 2008/2009 – 12. edycja Pucharu Świata w lotach narciarskich (stanowiącego część Pucharu Świata w skokach narciarskich), która rozpoczęła się 10 stycznia 2009 w Bad Mitterndorf, a zakończyła się 22 marca 2009 w Planicy. Rozegrano 6 konkursów indywidualnych oraz 3 drużynowe.
Przed sezonem 2008/09 Pucharu Świata w skokach narciarskich przywrócono Małą Kryształową Kulę za loty narciarskie. Po raz ostatni to trofeum wręczono w sezonie 2000/01. Klasyfikacje pomiędzy tymi sezonami są więc nieoficjalne.
Kalendarz zawodów Lp.DataMiejscowośćHSUwagi1. miejsce2. miejsce3. miejsce1.10 stycznia 2009 Bad MitterndorfHS-200– Gregor Schlierenzauer Simon Ammann Martin Koch2.11 stycznia 2009 Gregor Schlierenzauer Harri Olli Simon Ammann3.14 lutego 2009 OberstdorfHS-213– Harri Olli Anders Jacobsen Johan Remen Evensen4.15 lutego 2009druż.5.14 marca 2009 VikersundHS-207druż.6.15 marca 2009– Gregor Schlierenzauer Simon Ammann Dmitrij Wasiljew7.20 marca 2009 PlanicaHS-215– Gregor Schlierenzauer Adam Małysz Dmitrij Wasiljew8.21 marca 2009druż.Rozegrano jedną serię.9.22 marca 2009– Harri Olli Adam Małysz Simon Ammann Robert Kranjec Puchar Świata w lotach narciarskich 2008/2009 – klasyfikacja końcowa Gregor Schlierenzauer Harri Olli Simon Ammann