Chociaż użycza swojego nazwiska do promowania kilku ostatnich projektów, Molyneux nie był w rzeczywistości głównym projektantem Fable, The Movies, czy Black & White 2.
6 kwietnia 2006 r. Lionhead Studios zostało kupione przez Microsoft i obecnie jest częścią Microsoft Game Studios. Na E3 2006 Peter Molyneux udzielił kilku wywiadów dla prasy, w których stwierdził, że „teraz kiedy jego Lionhead Studios jest częścią Microsoftu, jest bardziej niezależne, niż kiedy było niezależnym studiem”Kikizo interview..
W marcu 2009 r. Peter Molyneux został dyrektorem kreatywnym Microsoftu w Europie i pomagał przy pracach nad Kinectem – kontrolerem dla konsoli Xbox 360. 7 marca 2012 r., po ukończeniu Fable: The Journey, Molyneux zrezygnował ze stanowisk w Lionhead Studios i Microsofcie. Wraz z Timem Rancem założył studio 22Cans.
Gry Tytuły współtworzone przez Molyneux to:
Przed powstaniem studia Bullfrog The Entrepreneur (1984) (Projektant/Programista) Druid 2