Wśród jego zainteresowań badawczych na przestrzeni lat były: zasady procesowe, organizacja prokuratury, model postępowania przygotowawczego, zagadnienia dowodowe (w tym instytucja świadka koronnego i świadka incognito), anglosaska zasada owoców zatrutego drzewa, a także różne aspekty dotyczące przebiegu procesu sądowego, takie jak konsensualizm, analiza uprawnień uczestników postępowania na tle standardu konstytucyjnego, prawo prasowe, postępowania szczególne, kwestie konwalidacji czynności procesowych, pragmatyzm i antypragmatyzm w procesie karnym, obstrukcja procesowa, czyli nadużywania prawa, przewlekłość postępowania.
Współpracował przy publikacjach z Kazimierzem Buchałą, Marianem Cieślakiem czy Andrzejem Markiem. We wrześniu 2004 za książkę Na tropach doktora Fausta i inne szkice otrzymał nagrodę Krakowska Książka Miesiąca. Był promotorem około trzystu siedemdziesięciu prac magisterskich i kilkunastu rozpraw doktorskich. Wśród jego studentów byli m.in. Zbigniew Doda, Barbara Nita-Światłowska, Andrzej Światłowski, Dobrosława Szumiło-Kulczycka i Antoni Bojańczyk.