Drzwi kościoła zostały przyozdobione okuciami wykonanymi w kuźni zakładów opiekuńczych. W warsztatach należących do placówki powstała również tablica umieszczona w przedsionku z inskrypcją: Das Gebet der Elenden dringt durch die Wolken. Sir 35,21. Mieszkańcy „Bethesdy” byli także autorami płaskorzeźb przedstawiających zboże i winogrona, które umieszono na ołtarzu oraz ambonie, powstały one według projektu Richarda Suchodolskiego.
W prezbiterium ustawiona została rzeźba Chrystusa ukrzyżowanego o wysokości 4 metrów, która wytworzona została w Unterammergau przez Dominika Schwaba. Modernistyczne witraże zdobiące okna powstały w latach 1930–1933 w zakładzie Otto Petersa w Paderborn. Przedstawiają one sylwetki ewangelistów oraz apostołów. We wnętrzu umieszczony został również chór, oparty na czterech kolumnach, ponad którą znajdowała się kolejna galeria, o mniejszych rozmiarach.
W 1945 kościół został odebrany parafii ewangelickiej przez władze i na mocy decyzji wojewody olsztyńskiego z dnia 30 września 1947 został przeznaczony do użytku rzymskokatolickiej parafii garnizonowej.