Martin Brunner (ur. 23 kwietnia 1963 w Zurychu) – szwajcarski piłkarz grający na pozycji bramkarza.
Kariera klubowa Piłkarską karierę Brunner rozpoczął w rodzinnym Zurychu, w klubie Grasshopper Club i w sezonie 1983/1984 zadebiutował w jego barwach w rozgrywkach pierwszej ligi szwajcarskiej i jako rezerwowy został wicemistrzem kraju. Już w swoim drugim sezonie stał się podstawowym bramkarzem "Koników Polnych". W 1988 roku zdobył swój pierwszy szwajcarski puchar, a osiągnięcie to powtórzył także w dwóch kolejnych sezonach. W 1990 roku został też po raz drugi mistrzem kraju, a w 1991 roku obronił z Grasshoppers tytuł mistrzowski. W 1994 roku znów został zdobywcą krajowego pucharu, a po sezonie odszedł z klubu, dla którego wystąpił 276 razy w lidze Szwajcarii.
W 1994 roku Brunner został bramkarzem zespołu Lausanne Sports. W klubie z Lozanny wygrał rywalizację o miejsce w bramce z Fabrice'em Borerem i został pierwszym golkiperem. W Lausanne bronił przez pięć sezonów. W swoich dwóch ostatnich, czyli 1997/1998 i 1998/1999 wywalczył Puchar Szwajcarii.