9 listopada 2010 Prezydent RP, Bronisław Komorowski, na wniosek Ministra Obrony Narodowej, mianował go generałem brygady.
20 września 2013, premier Donald Tusk, na wniosek o odwołanie generała złożony przez szefa Ministerstwa Obrony Narodowej Tomasza Siemoniaka, podjął decyzję o rozpoczęciu procedury odwołania szefa SKW, Janusza Noska. Informację opublikowało tego dnia Centrum Informacyjne Rządu. Formalne odwołanie nastąpiło 8 października 2013. .
Kontrowersje 6 grudnia 2017 został przesłuchany przez prokuraturę w charakterze podejrzanego o przekroczenie uprawnień lub niedopełnienie obowiązków jako szef SKW oraz działania na rzecz obcego wywiaduGrzegorz Rzeczkowski, Obrona przez atak, "Polityka", 2017, nr 50, s. 24-26. w związku z umową o współpracy zawartą we wrześniu 2013 roku pomiędzy Służbą Kontrwywiadu Wojskowego a Federalną Służbą Bezpieczeństwa Federacji Rosyjskiej. Postępowanie to zostało umorzone 23 kwietnia 2024 roku z uwagi na brak znamion czynu zabronionego. W tzw. Raporcie Bodnara stwierdzono, że w przedmiotowej sprawie dopuszczono się wielu rażących błędów stanowiących obrazę prawa i nie ustrzeżono się od naruszenia zasady niezależności prokuratora.