Jonathan Bottinelli (ur. 14 września 1984 w Buenos Aires) – argentyński piłkarz występujący na pozycji środkowego obrońcy. Obecnie gra w meksykańskim Club León.
Kariera klubowa Jonathan Bottinelli zawodową karierę rozpoczął w 2002 w klubie San Lorenzo de Almagro. W debiutanckim sezonie rozegrał dla niego siedem ligowych spotkań, natomiast w kolejnych rozgrywkach wystąpił w pięciu meczach argentyńskiej pierwszej ligi. Dopiero w sezonie 2004/2005 Bottinelli zaczął grywać częściej i łącznie brał udział w piętnastu pojedynkach Primera División. Miejsce w podstawowej jedenastce San Lorenzo wywalczył sobie jednak w kolejnych rozgrywkach, kiedy to rozegrał 35 ligowych meczów. Największym sukcesem jaki Argentyńczyk odniósł ze swoim zespołem było zajęcie pierwszego miejsca w końcowej tabeli Clausura 2006/2007.