W 2016 powołany w skład Komitetu Polityki Naukowej.
Został wiceprezesem zarządu Fundacji Kyoto-Kraków, wiceprzewodniczącym rady programowej Kongresu Obywatelskiego, członkiem rady Muzeum Narodowego w Krakowie, komitetu naukowego Collegium Artium oraz IEEE i rady zarządzającej organizacji naukowej Science Europe. Od 2013 członek korespondent Polskiej Akademii Nauk, a od 2022 członek rzeczywisty PAN. W październiku 2015 wybrany na prezesa oddziału Polskiej Akademii Nauk w Krakowie. W 2017 został wybrany na członka Academia Europaea, a w 2020 wybrano go na członka korespondenta Polskiej Akademii Umiejętności. W 2022 powołano go w skład Rady Muzeum przy Muzeum Sztuki i Techniki Japońskiej „Manggha” w Krakowie, następnie wybrano go na przewodniczącego tego gremium. Został też członkiem rady doradczej wydawnictwa Springer Nature.
W 2017 Komisja Europejska powołała go na członka Rady Naukowej Europejskiej Rady ds. Badań Naukowych. W 2020 wybrano go na stanowisko wiceprzewodniczącego tej instytucji (z kadencją od 2021). W kadencji 2008–2009 pełnił funkcję wiceprezesa stowarzyszenia. W kadencji 2022–2024 był przewodniczącym ds.