Podczas II wojny światowej gmina znajdowała się przejściowo poza administracją polską. Przejściowo, na początku 1944 roku, gminę Obrubniki zniesiono, tworząc z niej gminę Dobrzyniewo, którą jednak zniesiono w sierpniu 1944, przywracając gminę ObrubnikiJemielity W. (1993). Podziały administracyjne powiatów białostockiego i monieckiego w latach 1919-1990. "Studia Teologiczne", 11, 1993, s. 307-339..
PRL (1944–1954)
Po wojnie gmina należała do powieatu białostockiego w woj. białostockim.
1 czerwca 1951 utworzono nową gromadę Bogdan z części gromady Letniki, a zniesiono gromadę Krzywe, włączając ją do gromady Dobrzyniewo KościelneBiałostocki Dziennik Wojewódzki. 1951, nr 6, poz. 43.
W dniu 1 lipca 1952 roku gmina była podzielona na 26 gromad: Bogdan, Borsukówka, Chraboły, Dobrzyniewo Duże, Dobrzyniewo Kościelne, Gniła, Jaworówka, Katrynka, Kobuzie, Kopisk, Kozińce, Krynice, Kulikówka, Letniki, Nowo-Aleksandrowo, Nowiny Kasjerskie, Nowiny-Zdroje, Nowosiołki, Obrubniki, Ogrodniki, Podleńce, Pogorzałki, Ponikła, Rybaki, Rybniki i SzaciłyWykaz Gromad Polskiej