Budowle Klasyfikacja budynków na terenie Uaxactún została przyjęta wg ściśle ustalonych norm. Każda grupa budynków została podzielona i nazwana pierwszymi literami alfabetu łacińskiego (od „A” do „H”) Wyjątkiem stanowią dwie pierwsze grupy „A” i „B” które są podzielone na kolejne podzespołyValdés J. A. Breve historia de la arquitectura de Uaxactún a la luz de nuevas investigaciones // Journal de la Société des Américanistes. Paris, 1988.:
Grupa A Stanowiła centrum miasta w okresie klasycznym. Składa się z trzydziestu czterech kamiennych budynków podzielonych na trzy podgrupy. W pobliżu centrum tej grupy znajduje się jaskinia el – Respiradero. Jaskinia ta do 150 r. p.n.e. służyła jako miejsce do składania pochówków. mały|Pałac A-18
Grupa B Składa się z trzydziestu sześciu budynków. Grupa ta została podzielona na dwie podgrupy. Główny rdzeń (Rynek Główny) i mniejszy kompleks budynków położonej na wschód od niego.
Grupa C W grupie tej są zachowane bardzo dobrze konstrukcje elitarne które nabrały charakteru w okresie późnym klasycznym.