Latem 1992 roku Emmers odszedł do stołecznego Anderlechtu. Na skutek dużej konkurencji w składzie nie zawsze grał w wyjściowej jedenastce "Fiołków". W latach 1993–1995 trzykrotnie z rzędu zdobywał mistrzostwo Belgii, jednak w pełnił wówczas rolę rezerwowego. W 1994 roku zdobył także Puchar Belgii. Sezon 1995/1996 opuścił z powodu kontuzji, a w następnym rozegrał tylko 5 meczów i ostatecznie odszedł z Anderlechtu.
W 1997 roku Marc odszedł do włoskiej Perugii, jednak w Serie A grał tylko pół roku. Na początku 1998 roku trafił do szwajcarskiego AC Lugano, którego zawodnikiem był do lata 1999. Wtedy też wrócił do Belgii i przez jeden sezon grał w trzecioligowym KTH Diest. W 2000 roku zakończył karierę.
Sezon Klub Kraj Rozgrywki Mecze Bramki 1983/84 Waterschei SV Thor
I liga 9 1 1984/85 Waterschei SV Thor
I liga 34 2 1985/86 Waterschei SV Thor
I liga 29 9 1986/87 Waterschei SV Thor
II liga 26 2 1987/88 KV Mechelen
I liga 27 6 1988/89 KV Mechelen
I liga 33 9 1989/90 KV Mechelen
I liga 34 9 1990/91 KV Mechelen
I liga 30 4 1991/92 KV Mechelen
I liga 31 5 1992/93 RSC Anderlecht
I liga 14 1 1993/94 RSC Anderlecht
I liga 16 1 1994/95 RSC Anderlecht
I liga 25 1 1995/96 RSC Anderlecht
I liga 0 0 1996/97 RSC Anderlecht
I liga 5 0 1997/98 AC