Fabuła Historia rozpoczyna się na nie w pełni zbadanej planecie, gdzie ekspedycja wysłana z pobliskiej stacji dokonuje niezwykłego odkrycia tzw. Znaku (Symbolu) (ang. Artifact), który przypuszczalnie może pochodzić od samego Boga. Wkrótce na orbicie pojawia się kosmiczny łamacz planet USG Ishimura. Z polecenia kapitana Mathiusa i dr Kyne'a znalezisko zostaje zabrane na pokład. Od tego momentu na Ishimurze wzrasta napięcie pomiędzy członkami załogi. Religijna grupa Unitologów domaga się dostępu do Znaku, który ma być reliktem związanym z ich wierzeniami. Sytuacja zostaje jednak złagodzona przez jednego z górników, mechanika Ironsa.
Tymczasem urywa się kontakt ze stacją planetarną, która zostaje zaatakowana przez obcą formę życia. Naocznym świadkiem rozgrywającego się wokół koszmaru jest jeden z pracowników stacji. Próbuje ratować swoją dziewczynę, ale ta niespodziewanie popełnia samobójstwo. Zabierając jej ciało, pełen determinacji mężczyzna zbiega do wahadłowca i rusza na orbitę.