W sezonie 2024/25 Borac rozpoczął eliminacje do europejskich rozgrywek od eliminacji do Ligi Mistrzów, w pierwszej rundzie wygrywając po konkursie rzutów karnych z albańskim klubem Egnatia Rrogozhinë, w drugiej przegrywając z greckim PAOK. Porażka ta zdegradowała Boraca do eliminacji do Ligi Europy, gdzie w trzeciej rundzie podejmował on farerski KÍ Klaksvík, wygrywając po dogrywce i awansując do czwartej rundy kwalifikacji. Czwarty dwumecz w tym sezonie rozgrywany był z węgierskim klubem Ferencvárosi TC. Klub z Bośni i Hercegowiny przegrał w rzutach karnych, jednakże porażka w IV rundzie kwalifikacji Ligi Europy dała przegranemu klubowi możliwość występów w fazie ligowej Ligi Konferencji.
W fazie ligowej Ligi Konferencji w sezonie 2024/25 Borac wygrał z cypryjskim klubem APOEL, austriackim LASK, zremisował z greckim Panathinaikosem i cypryjską Omonią Nikozja oraz przegrał z islandzkim Víkingurem Reykjavík i irlandzkim Shamrock Rovers. Wyniki te zagwarantowały Boracowi 20. miejsce w tabeli ligowej, zapewniające udział w wiosennej fazie play-off. Przeciwnikiem Boraca został słoweński klub Olimpija. Dzięki pokonaniu Słoweńców u siebie (1:0) i remisowi na wyjeździe (0:0), klub awansował do 1/8 rozgrywek, gdzie zmierzy się z Rapidem Wiedeń.