Z The Mars Volta Rok Tytuł Uwagi 2003 De-Loused in the Comatorium Wytwórnia: Universal Music Group Data wydania: 24 czerwca 2003 Pierwszy album z The Mars Volta 2005 Frances the Mute Wytwórnia: Universal Music Group Data wydania: 1 marca 2005 Muzyk dodał dwie partie solowe do utworu „L’Via L’Viaquez” 2006 Amputechture Wytwórnia: Universal Music Group Data wydania: 12 września 2006 Muzyk gra na gitarze na wszystkich utworach prócz „Asilos Magdalena” 2007Se Dice Bisonte, No Bùfalo Wytwórnia: Gold Standard Laboratories Data wydania: 29 maja 2007 2008 The Bedlam in Goliath Wytwórnia: Gold Standard Laboratories Data wydania: 29 stycznia 2008
Z Omarem Rodriguez-Lopez Rok Tytuł Uwagi 2007Se Dice Bisonte, No Bùfalo Wytwórnia: Gold Standard Laboratories Data wydania: 29 maja 2007
Albumy internetowe Rok Tytuł2001From the Sounds Inside Wytwórnia: – Data wydania: 2001
Kompilacje Rok Tytuł Uwagi 2003 Greatest Hits Wytwórnia: Warner Bros. Records Data wydania: 11 listopada 2003 Frusciante gra na gitarze we wszystkich utworach z wyjątkiem „My Friends”Poligrafia do albumu One Hot Minute.
Albumy koncertowe Rok Tytuł Uwagi 2004 Live in Hyde Park Wytwórnia: Warner Bros.