W latach 1998–2001, w czasie rządów koalicji AWS-UW, Bogdan Chazan pełnił stanowisko Krajowego Konsultanta w Dziedzinie Położnictwa i Ginekologii, z którego został zwolniony przez Ministra Zdrowia Mariusza Łapińskiego na skutek skarg Federacji na rzecz Kobiet i Planowania Rodziny zarzucających Bogdanowi Chazanowi wydawanie niezgodnych z prawem opinii. W latach 2004–2014 Bogdan Chazan był dyrektorem ginekologiczno-położniczego Szpitala Specjalistycznego im. Świętej Rodziny w Warszawie.
Został członkiem Rządowej Rady Ludnościowej, zasiadając w niej przez kilka kadencji, w latach 1992–2007 i ponownie od 2012. Został członkiem Komitetu Nauk Demograficznych przy Wydziale I Nauk Humanistycznych i Społecznych Polskiej Akademii Nauk oraz członkiem komisji problemowych Regionalnego Biura Europejskiego Światowej Organizacji Zdrowia i Rady Europy. Został przewodniczącym Rady organizacji MaterCare International pomagającej matkom i dzieciom w krajach rozwijających (np. Kenia, Haiti, po trzęsieniu ziemi z 2010). Był recenzentem kilku podręczników Ministerstwa Edukacji Narodowej ścieżki międzyprzedmiotowej „Wychowanie do życia w rodzinie”. Został nauczycielem akademickim na Uniwersytecie Jana Kochanowskiego w Kielcach i wszedł w skład Rady Wydziału Nauk o Zdrowiu tej uczelni.