Obie te osady (vicus) zostały połączone w jeden organizm miejski podczas lokacji, która miała miejsce między 1250 a 1275 rokiemK. Bartkiewicz, Dzieje Ziemi Kłodzkiej w wiekach średnich, Wrocław 1977, s. 41–42.. Jednak jej dokładna data nie jest znana ze względu na brak zachowanego dokumentu lokacyjnegoKłodzko. Dzieje miasta, pod red. R. Gładkiewicza, Kłodzko 1998, s. 38..
Średniowiecze thumb|240px|Jeden z najstarszych wizerunków Kłodzka autorstwa Matthäusa Meriana z 1650 roku W ciągu następnych kilkudziesięciu lat Kłodzko stało się ważnym ośrodkiem administracyjnym i wojskowym na ziemi kłodzkiej oraz znaczącym ośrodkiem handlowym. Funkcjonował tutaj sprowadzony w 2 połowie XII wieku zakon joannitów, który przejął opiekę nad dwoma wymienionymi wcześniej świątyniami oraz wzniósł nowy kościół, szpital i klasztorK. Bartkiewicz, Dzieje Ziemi Kłodzkiej w wiekach średnich, Wrocław 1977, s. 175–177..