Życie prywatne W latach 1967–1987 był żonaty z brytyjską wiolonczelistką, Jacqueline du Pré (1945–1987). Koncertowali na całym świecie – Barenboim występował z du Pré jako dyrygent i pianista. Choroba du Pré – zdiagnozowano u niej stwardnienie rozsiane – spowodowała, że w 1973, poruszająca się na wózku inwalidzkim, przerwała karierę muzyczną. Na początku lat 80. Barenboim związał się z pianistką . Bezskutecznie ukrywał ten fakt przed du Pré. Wkrótce Baszkirowa urodziła dwoje dzieci: Davida (1982) i Michaela (1985). Barenboim i du Pré pozostali formalnie małżeństwem do jej śmierci w 1987. Rok później muzyk poślubił Baszkirową.
Daniel Barenboim posiada obywatelstwa Izraela i Argentyny oraz honorowe – Hiszpanii i Autonomii Palestyńskiej.
Odznaczenia 2007 – Komandor Legii Honorowej (Francja) 2007 – Kawaler Krzyża Wielkiego Orderu Zasługi Republiki Włoskiej (Włochy) 2011 – Wielki Oficer Legii Honorowej (Francja) 2011 – Rycerz Komandor Orderu Imperium Brytyjskiego (Wielka Brytania) 2013 – Wielki Krzyż Zasługi z Gwiazdą i Wstęgą (Niemcy) 2015 – Order Pour le Mérite (Niemcy) 2023 – Krzyż Wielki Legii Honorowej (Francja)