Aktualnie OS X jest jedynym systemem operacyjnym, który w pełni obsługuje Mighty Mouse. Przyciski myszy są wtedy programowalne: mogą włączać aplikacje lub różne funkcje systemu Mac OS X, jak na przykład Exposé, czy Dashboard. Jeśli mysz nie jest użyta z Mac OS X, zachowuje się jak zwykła czteroprzyciskowa mysz z dwoma scrollami. Istnieją dodatkowe aplikacje na system Windows, dzięki którym mysz ma więcej funkcji pracując pod kontrolą tego systemu.
Mighty Mouse nie wykrywa równoczesnego kliknięcia lewym i prawym przyciskiem myszy. To oznacza, że skróty w oprogramowaniu CAD, grach, przeglądarkach internetowych i innych aplikacjach nie mogą być użyte.
Konstrukcja Mighty Mouse sprawia, że scroll ball po kilku miesiącach użytkowania przestaje działać. Rozwiązań jest kilka: od prostego odwrócenia myszy i przesuwania scrolem po kartce po rozbieranie myszy i kompleksowe czyszczenie. Mysz znana jest z tego że w ciągu okresu jej używania trzeba powtarzać te czynności dosyć często i co za tym idzie mysz jest dosyć uciążliwa w użytkowaniu.
Wersje i daty sprzedaży
2 sierpnia 2005 Apple wprowadziło do swojej oferty pierwszą Mighty Mouse, o sugerowanej cenie detalicznej $49.