Po ukończeniu studiów pierwszego stopnia ich absolwenci mogą kontynuować naukę na studiach drugiego stopnia (magisterskich uzupełniających, 2-letnich). Do wyboru mają oni następujące kierunki i specjalizacje: historia [on-line] [dostęp 2017-10-21]. nauczycielska regionalna dokumentacja archiwalno-archeologiczna historia i zarządzanie dobrami kultury dziedzictwo kulturowe Europy Środkowej zarządzanie współczesną dokumentacją regionalną researchingOpis kierunku researching na stronie IH UO [on-line] [dostęp 2017-10-22]. historyczna muzykologiczna
Ponadto instytut prowadzi studia podyplomowe [on-line] [dostęp 2017-10-11].: w zakresie historii, przygotowujące merytorycznie do nauczania przedmiotu „historia” oraz „historia i kultura Niemiec”; informacja naukowa i bibliotekoznawstwoStudia prowadzone są wspólnie przez pracowników Instytutu Historii oraz Biblioteki Głównej Uniwersytetu Opolskiego.