System Informacyjny Schengen (SIS, ) – komputerowa baza danych, która pozwala na sprawdzenie, czy osoby lub przedmioty przekraczające granicę strefy Schengen bądź już znajdujące się na jej terenie, nie są poszukiwane, niejawnie nadzorowane lub czy nie dotyczy ich zakaz wstępu.
System SIS jest najstarszym systemem wspomagającym zarządzanie migracjami, a zwłaszcza przepływ osób w UE i kontrolę granic.
Dostęp do systemu mają służby policyjne, celne, graniczne i imigracyjne, a także unijne agencje Europol, Eurojust i Frontex.
Geneza SIS związana jest z instrumentarium przyjętym w 1990 r. w ramach Konwencji Wykonawczej do Układu z Schengen. System SIS rozpoczął funkcjonowanie w 1995 r., lecz zintegrowany rozwój wymiany informacji doprowadził do powstania jego drugiej generacji – SIS II – w latach 2001–2007. Nowe ramy prawne przyjęte w 2018 r., składające się z trzech rozporządzeń na temat współpracy policyjnej i sądowej w sprawach karnych, odpraw granicznych i powrotu obywateli państw trzecich przebywających w UE nielegalnie oznaczają, że system jest stale rozbudowywany o nowe funkcjonalności czy też integrowany z innymi modułami (np. – rozpoznającym tablice rejestracyjne czy – bazą Interpolu na temat skradzionych i utraconych dokumentów).