Kontrowersyjny rzut karny przyznany przez sędziego Claude'a Colombo za faul na Alainie Caveglii w 90. minucie przypieczętował zwycięstwo Nantes. Mickaël Landreau, kapitan i bramkarz FC Nantes, nagradza amatorów, oferując kapitanowi Calais, Réginaldowi Becque, rzadki przywilej wzniesienia trofeum razem z nim.
W sezonie 2005/06 CRUFC dotarł do ćwierćfinału Pucharu Francji, gdzie ponownie został wyeliminowany przez FC Nantes.
W sezonie 2009/10 zespół zajął pierwsze miejsce w grupie A CFA 2 i zdobył prawo powrotu do CFA, ale 10 czerwca 2010 klub został postawiony w stan likwidacji przymusowej przez High Court of Boulogne. Klub ostatecznie pozostał w CFA 2 do sezonu 2013/14. W 2014 roku klub powrócił do CFA po zajęciu 2. miejsca w swojej grupie CFA 2. Na koniec sezonu 2014/15 klub zajął 6. miejsce w mistrzostwach CFA grupy A. W kolejnym roku (2015/16) klub zajął 9. miejsce w CFA grupa A.
28 września 2017 sąd w Boulogne-sur-Mer orzekł likwidację klubu, co oznaczało jego definitywne zakończenie działalności.
Dziedzictwo Po zniknięciu Calais RUFC dwa kluby powstały dwa kluby w mieście:
W 2017 powstało Calais FC Hauts-de-France. Klub składał się z byłych liderów i członków Calais RUFC.