Instytut Historii Uniwersytetu Jagiellońskiego (IH UJ) – jednostka organizacyjna Uniwersytetu Jagiellońskiego w Krakowie, powołana do życia 24 kwietnia 1970. Jeden z sześciu instytutów tworzących Wydział Historyczny Uniwersytetu Jagiellońskiego.
Dzieli się na pięć katedr i dwa zakłady i zatrudnia obecnie 74 pracowników naukowo-dydaktycznych, w tym 47 samodzielnych. Prowadzi działalność dydaktyczną i badawczą związaną z historią polityczną, społeczną i gospodarczą w jej poszczególnych epokach. Instytut oprócz „klasycznej” historii oferuje także studia z antropologii historycznej. Siedzibą instytutu jest gmach Collegium Witkowskiego przy ul. Gołębiej 13, część zakładów mieści się przy ul. św. Anny 6.
Instytut w latach 1953–1992 działał w ramach Wydziału Filozoficzno-Historycznego UJ, od reorganizacji struktur uniwersyteckich w 1992 w ramach Wydziału Historycznego.
Władze Dyrektor: dr hab. Janusz Mierzwa, prof. UJ Zastępca: dr hab. Katarzyna Kuras, prof. UJ Zastępca ds. studenckich: dr Tomasz Grabowski