Obecnie o aktywności wulkanicznej Yellowstone świadczą liczne gorące źródła, kotły błotne, intensywnie zabarwione zbiorniki wodne oraz gejzery, w tym jeden z najsłynniejszych – Old Faithful. Pod powierzchnią znajdują się rozległe magazyny magmy, a wzrost ciśnienia wewnętrznego powoduje okresowe wyrzuty pary wodnej i wody pod dużym ciśnieniem. Teoretyczne zbieżne wystąpienie określonych czynników geologicznych mogłoby doprowadzić do ponownej erupcji o skali określanej mianem katastrofalnej. Oprócz trwającej aktywności wulkanicznej podłoże kaldery oraz jej otoczenie charakteryzują się występowaniem licznych, aktywnych struktur tektonicznych w postaci fałd i uskoków. W połączeniu z ruchami magmy powodują one występowanie znacznej liczby trzęsień ziemi. W 2008 roku odnotowano około 2300 takich wstrząsów, z których większość była niewykrywalna dla ludzkich zmysłów. W przeszłości jednak zdarzały się trzęsienia o poważnych skutkach, jak np. wstrząs w rejonie z 1959 roku, o magnitudzie 7,5 w skali Richtera.