Duya, Veluz, VandeVrede & Steppan, 2011filipinomysz krótkoogonowagatunek monotypowyLuzon (góra Banahaw i Banahaw de Lucban; prawdopodobnie góra San Cristobal); zakres wysokości: 1465–1750 m n.p.m.DC: 12,5–15,4 cmDO: 11,1–13,3 cmMC: 71–92 gMegapomysApomys sacobianus D.H. Johnson, 1962filipinomysz długonosagatunek monotypowyzachodni Luzon (góra Pinatubo, góry Zambales; być może szerzej rozpowszechniony); zakres wysokości: 365–1080 m n.p.m.DC: 13,5–15,8 cmDO: 11,5–15,9 cmMC: 71–105 gMegapomysApomys lubangensisHeaney, Balete, Veluz, Steppan, Esseltyn, Pfeiffer & Rickart, 2014gatunek monotypowyLubang (góra Ambulong); zakres wysokości: 130–450 m n.p.m.DC: 14,3–16 cmDO: 12,8–15,4 cmMC: 102–128 gMegapomysApomys abrae(Sanborn, 1952)filipinomysz reliktowagatunek monotypowypółnocno-zachodni Luzon (Kordyliera Centralna); zakres wysokości: 925–2200 m n.p.m.DC: 12,1–14,1 cmDO: 12–14,4 cmMC: 50–79 gMegapomyscentruj|150pxApomys datae(A.B. Meyer, 1899)filipinomysz stokowagatunek monotypowypółnocno-zachodni Luzon (Kordyliera Centralna);