Podokręg Kowno ZWZ – jeden z elementów struktury Związku Walki Zbrojnej.
Komenda Okręgu Wileńskiego, wysoko ceniąc patriotyzm kowieńskich Polaków, widziała we współpracy z nią liczne korzyści dla działalności konspiracyjnej ZWZ. Zdecydowała nadać współpracy formę bardziej zorganizowaną i skoordynowaną. Podokręg utworzono w sierpniu 1940 roku w miejsce funkcji delegata ZWZ na Kowno Delegatem ZWZ był ppor. Zbigniew Jentys ps. "Habdank". Przekształcony w Inspektorat E Okręgu AK Wilno.
Działania konspiracyjne
Działalność konspiracyjna skupiała się przede wszystkim na: utrzymaniu systemu łączności między Kownem a Wilnem organizowaniu przerzutów kurierów między Wilnem a Warszawą przez Prusy Wschodnie i Suwałki utrzymywaniu systemu obserwacji transportów kolejowych przebiegających przez teren Litwy udzielaniu wszechstronnej pomocy polskim wojskowym – uciekinierom z obozów internowania kolportowaniu polskiej prasy podziemnej szkoleniu wojskowym i dywersyjnym członków konspiracji.
Na skutek aresztowań wiosną 1941, działalność konspiracyjna uległa znacznemu ograniczeniu.