Istnieją składy podatkowe produkcyjne, magazynowe i produkcyjno-magazynowe. Składy produkcyjne, są to składy, w których prowadzona jest działalność produkcyjna wyrobów akcyzowych, mogą one też być w nim magazynowane (ale gdy jest to powiązane z procesem produkcyjnym). W magazynowym składzie podatkowym, wyroby akcyzowe mogą być tylko magazynowane. W składzie produkcyjno-magazynowym wyroby akcyzowe mogą być produkowane i magazynowane. Przy czym magazynowane wyroby nie są bezpośrednio związane z czynnościami produkcyjnymi prowadzonymi w składzie.
Skład podatkowy działa w oparciu o regulamin funkcjonowania składu podatkowego. Projekt tego regulaminu przedkłada się wraz z wnioskiem o zezwolenie na prowadzenie składu podatkowego. Właściwy naczelnik urzędu celnego przy wydawaniu zezwolenia zatwierdza regulamin funkcjonowania składu podatkowego.