19 marca 1896 roku został zwolniony ze stanowiska młodszego architekta w wydziale konstrukcyjnym władz prowincji petersburskiej. 29 grudnia 1902 roku został mianowany technikiem w biurze komisji budowy koszar, pozostając na dotychczasowym stanowisku. W tym samym roku otrzymał stopień radcy stanu. Działał w środowisku Polonii w St. Petersburgu, wspierając materialnie studiujących tam polskich studentów.
Jest autorem wielu domów mieszkalnych i rezydencji na terenie Rosji. Do najbardziej znaczących projektów użyteczności publicznej należy zaliczyć projekt zespołu budynków szpitala psychiatrycznego im Piotra Piotrowicza Kaszczenko w Nikolskim k. St. Petersburga. Należy dodać, że lekarz ten był jednym z twórców nowoczesnej psychiatrii w Rosji i jako taki pełnił funkcję głównego konsultanta Józefa Moszyńskiego przy projektowaniu i budowie szpitala. Kompleks szpitalny zlokalizowany jest w miejscowości, która dawniej była nazywana Siworice.
W 1903 roku, dla siebie, swojej matki i rodzonej siostry wraz z rodziną, wybudował w Grodzisku Mazowieckim przy ul. Kościuszki 12 (dawnej Ogrodowej) charakterystyczną willę z wieżą. Utrzymany w stylu secesyjnym budynek nosi nazwę „Niespodzianka”. Moszyński prawdopodobnie jest także autorem grodziskiego „domu rejenta” przy ul. Bałtyckiej oraz budynku przy ul.