W latach 1992–2001 zespół AZS-u nieprzerwanie występował w I lidze.
MMKS Katarzynki Po sezonie 2004/2005, dla torunianek drugim z rzędu spędzonym na zapleczu ekstraklasy, drużyna akademiczek została rozwiązana, a w lipcu 2005 roku powołano do życia Miejski Międzyszkolny Klub Sportowy Katarzynki, który zajął miejsce drużyny AZS-u. Sponsorem tytularnym pozostało przedsiębiorstwo Nova Trading, a trenerem nadal był Maciej Broczek. Zespół Katarzynek zakończył sezon w pierwszej lidze (po reorganizacji – druga klasa rozgrywkowa) bez porażki. Zwyciężył także w turnieju finałowym i awansował do Polskiej Ligi Koszykówki Kobiet.
Pierwszy sezon po powrocie Torunia do najwyższej klasy rozgrywkowej nie był zbyt udany. Podopieczne Broczka zajęły ostatecznie 11. miejsce na 12 drużyn. Oznaczało to degradację, której jednak Katarzynki uniknęły dzięki zmianie organizacji ligi oraz wykupieniu tzw. „dzikiej karty”.