miejsce w lidze, co było najgorszym ligowym występem klubu w historii.
Pomimo rekordowo wysokich porażek z klubami Belfast Celtic i Derry City w latach 1937 i 1938, sytuacja klubu Ballymena United stawała się coraz lepsza, aż w końcu w sezonie 1938/39 klub został wicemistrzem Irlandii oraz dotarł do finału krajowego pucharu, gdzie przegrał 0:2 z Linfield – był to trzeci przegrany finał Ballymena United w latach 30.
Kolejny raz do finału Pucharu Irlandii klub dotarł w 1940 roku, gdzie czekał na niego Glenavon Lurgan. W finale Ballymena United wygrał 2:0 i po 11 latach drugi raz w swej historii świętował zdobycie krajowego pucharu.
Po zwycięskim pucharze klub oddał swój stadion Showgrounds do użytku wojskowego, by wspomóc wysiłek wojenny Wielkiej Brytanii. Klubowi obiecano powrót do ligi po zakończeniu wojny, jednak okazało się, że na udział w rozgrywkach ligowych klub poczekać musiał jeszcze wiele lat po II wojnie światowej.