Zespół Szkół Ponadgimnazjalnych nr 1 W 1999 r. doszło do reformy systemu edukacji w Polsce, w wyniku którego powołano gimnazja oraz zreformowano szkolnictwo średnie, w efekcie czego przekształceniu uległo wiele szkół. W ramach Zespołu Szkół Budowlanych utworzono dodatkowo liceum profilowane i liceum ogólnokształcące, przekształcając w ten sposób ZSB w Zespół Szkół Ponadgimnazjalnych nr 1, zachowując jako patrona prof. Wacława Żenczykowskiego, co miało oficjalnie miejsce w 2002 r. W tym samym czasie uruchomiono w szkole zamiejscowy ośrodek dydaktyczny Uniwersytetu Wrocławskiego, Powiatowe Centrum Doskonalenia Kadr. Swoją siedzibę znalazła także Biblioteka PedagogicznaM. Fornalski, Historia ZSP nr 1 w Kłodzku..
Osoby związane ze szkołą Waldemar Błaszczyk – aktor, uczeń szkoły Wojciech Brejter – sybirak, działacz opozycji Andrzej Cyman – burmistrz Nowej Rudy w latach 1994–1998 Wojciech Mecwaldowski – aktor, uczeń szkoły Czesław Nosal – psycholog, uczeń szkoły Marcin Leopold Oleniuk – podpułkownik, nauczyciel w szkole Michał Piszko – burmistrz Kłodzka od 2014 r., uczeń szkoły Henryk Urbanowski –